《X医生：外科医生大门未知子第3季》2014年，白色巨塔的崩溃没有停歇，新的医疗政策反而将医学界推入更加弱肉强食的世界。汇合了业内顶尖精英的国立高度医疗化中心创造，只不过这里却成为东西两派争权夺利的鏖战场。西京大学的谈合坂升（伊武雅刀饰）在院长蛭间重盛（西田敏行饰）的授意下向东大的海老名（远藤宪一饰）一方发起猛攻。而就在此时，病情极度复杂的毒岛隆之介（伊东四朗饰）被送入医疗中心。当所有人束手无策之际，法外医生大门未知子（米仓凉子饰）准时展示，力挽狂澜，令所有人刮目相看。中心理事天堂义人（北大路欣也饰）借此机会夺得总长职务，并高薪将大门纳入麾下。　　绝不依权附势的未知子，此番将迎接更大的挑战……